Cours : MSC1090 Introduction to Computational Biostatistics with R (Fall 2022)

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- MSC1090 Introduction to Computational Biostatistics with R (Fall 2022)
  The goal of this course is to prepare graduate students to perform scientific data analysis using the R programming language. Successful students will learn how to use statistical inference and machine-learning tools to gain insight into data sets, as well as be introduced to techniques and best practises for storing, managing and analyzing data. Topics will include: R programming, version control, modular programming, coding best practices, data analysis, machine learning and scientific visualization.
  Classes will be held Tuesdays and Thursdays, 9:00-10:30am, in GB244 and BL205, respectively.
  Students willing to take the course as part of their graduate program must enrol through Acorn. This course is part of the IMS graduate program.
  Teachers: Alexey Fedoseev, Erik Spence
  Start date: 13 Sep 2022
  End date: 29 Nov 2022
  Scientific Computing Credits: 8
  Data Science Credits: 28
  Events:
  MSC1090: Lecture 1 - Tuesday, 13 September, 9:00 AM » 10:30 AM
  MSC1090: Lecture 2 - Thursday, 15 September, 10:20 AM » 11:50 AM
  MSC1090: Lecture 3 - Tuesday, 20 September, 9:00 AM » 10:30 AM
  A full list of course events can be found here.
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Lectures
The lecture slides below are licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 International License.
- Fichier
  
  1. Introduction to Linux Shell I Fichier
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  2. Introduction to Linux Shell II Fichier
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  3. Introduction to R Fichier
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  4. Vectors and data frames Fichier
- Fichier
  
  5. Lists, loops and conditional statements in R Fichier
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  6. Functions in R Fichier
- Fichier
  
  7. Scripts Fichier
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  8. Version Control System - Git Fichier
- Fichier
  
  9. Coding Best Practices Fichier
- Fichier
  
  10. Distributions Fichier
- Fichier
  
  11. Hypothesis tests Fichier
- Fichier
  
  12. ANOVA Fichier
- Fichier
  
  13. Linear Models Fichier
- Fichier
  
  14. Generalized linear models Fichier
- Fichier
  
  15. Resampling Fichier
- Fichier
  
  16. Classification I Fichier
- Fichier
  
  17. Classification II Fichier
- Fichier
  
  18. Unsupervised learning Fichier
- Fichier
  
  19. Neural networks Fichier
- Fichier
  
  20. Visualization Fichier
- Fichier
  
  21. Ensemble methods Fichier
- Fichier
  
  22. File I/O Fichier
- Fichier
  
  23. Parallel Computing in R Fichier
- Fichier
  
  24. High-Performance Computing in R Fichier
Recordings
The recordings below are licensed under a Creative Commons Attribution-NoDerivatives 4.0 International License.
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  1. Introduction to Linux Shell I Fichier
- Fichier
  
  2. Introduction to Linux Shell II Fichier
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  3. Introduction to R Fichier
- Fichier
  
  4. Vectors and data frames Fichier
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  5. Loops and conditionals in R Fichier
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  6. Functions Fichier
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  7. Scripts Fichier
- Fichier
  
  8. Version control Fichier
- Fichier
  
  9. Coding Best Practices Fichier
- Fichier
  
  10. Distributions Fichier
- Fichier
  
  11. Hypothesis testing Fichier
- Fichier
  
  12. ANOVA Fichier
- Fichier
  
  13. Linear Models Fichier
- Fichier
  
  14. Generalized linear models Fichier
- Fichier
  
  15. Resampling Fichier
- Page
  
  16. Classification I Page
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  17. Classification II Fichier
- Fichier
  
  18. Unsupervised learning Fichier
- Fichier
  
  19. Neural networks Fichier
- Fichier
  
  20. Visualization Fichier
- Fichier
  
  21. Ensemble methods Fichier
- Fichier
  
  22. File I/O Fichier
- Fichier
  
  23. Parallel R Fichier
- Fichier
  
  24. High-performance R Fichier
Assignments
- Devoir
  
  Assignment 1 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 15 septembre 2022, 10:00
  
  À rendre : jeudi 22 septembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 2 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 22 septembre 2022, 10:00
  
  À rendre : jeudi 29 septembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 3 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 29 septembre 2022, 10:00
  
  À rendre : jeudi 6 octobre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 4 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 6 octobre 2022, 10:00
  
  À rendre : jeudi 13 octobre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 5 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 13 octobre 2022, 10:00
  
  À rendre : jeudi 27 octobre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 6 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 27 octobre 2022, 10:00
  
  À rendre : jeudi 3 novembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 7 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 3 novembre 2022, 10:00
  
  À rendre : jeudi 10 novembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 8 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 10 novembre 2022, 10:00
  
  À rendre : jeudi 17 novembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 9 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 17 novembre 2022, 10:00
  
  À rendre : jeudi 24 novembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 10 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 24 novembre 2022, 10:00
  
  À rendre : jeudi 1 décembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 11 - Make-up Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 1 décembre 2022, 10:00
  
  À rendre : jeudi 8 décembre 2022, 23:59

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