Cours : MSC1090 Introduction to Computational Biostatistics with R (Fall 2022)

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- MSC1090 Introduction to Computational Biostatistics with R (Fall 2022)
  The goal of this course is to prepare graduate students to perform scientific data analysis using the R programming language. Successful students will learn how to use statistical inference and machine-learning tools to gain insight into data sets, as well as be introduced to techniques and best practises for storing, managing and analyzing data. Topics will include: R programming, version control, modular programming, coding best practices, data analysis, machine learning and scientific visualization.
  Classes will be held Tuesdays and Thursdays, 9:00-10:30am, in GB244 and BL205, respectively.
  Students willing to take the course as part of their graduate program must enrol through Acorn. This course is part of the IMS graduate program.
  Teachers: Alexey Fedoseev, Erik Spence
  Start date: 13 Sep 2022
  End date: 29 Nov 2022
  Scientific Computing Credits: 8
  Data Science Credits: 28
  : 1
- Page
  
  Software Requirements Page
- Forum
  
  Student Forum
Lectures
- Fichier
  
  1. Introduction to Linux Shell I Fichier
- Fichier
  
  2. Introduction to Linux Shell II Fichier
- Fichier
  
  3. Introduction to R Fichier
- Fichier
  
  4. Vectors and data frames Fichier
- Fichier
  
  5. Lists, loops and conditional statements in R Fichier
- Fichier
  
  6. Functions in R Fichier
- Fichier
  
  7. Scripts Fichier
- Fichier
  
  8. Version Control System - Git Fichier
- Fichier
  
  9. Coding Best Practices Fichier
- Fichier
  
  10. Distributions Fichier
- Fichier
  
  11. Hypothesis tests Fichier
- Fichier
  
  12. ANOVA Fichier
- Fichier
  
  13. Linear Models Fichier
- Fichier
  
  14. Generalized linear models Fichier
- Fichier
  
  15. Resampling Fichier
- Fichier
  
  16. Classification I Fichier
- Fichier
  
  17. Classification II Fichier
- Fichier
  
  18. Unsupervised learning Fichier
- Fichier
  
  19. Neural networks Fichier
- Fichier
  
  20. Visualization Fichier
- Fichier
  
  21. Ensemble methods Fichier
- Fichier
  
  22. File I/O Fichier
- Fichier
  
  23. Parallel Computing in R Fichier
- Fichier
  
  24. High-Performance Computing in R Fichier
Recordings
- Fichier
  
  1. Introduction to Linux Shell I Fichier
- Fichier
  
  2. Introduction to Linux Shell II Fichier
- Fichier
  
  3. Introduction to R Fichier
- Fichier
  
  4. Vectors and data frames Fichier
- Fichier
  
  5. Loops and conditionals in R Fichier
- Fichier
  
  6. Functions Fichier
- Fichier
  
  7. Scripts Fichier
- Fichier
  
  8. Version control Fichier
- Fichier
  
  9. Coding Best Practices Fichier
- Fichier
  
  10. Distributions Fichier
- Fichier
  
  11. Hypothesis testing Fichier
- Fichier
  
  12. ANOVA Fichier
- Fichier
  
  13. Linear Models Fichier
- Fichier
  
  14. Generalized linear models Fichier
- Fichier
  
  15. Resampling Fichier
- Page
  
  16. Classification I Page
- Fichier
  
  17. Classification II Fichier
- Fichier
  
  18. Unsupervised learning Fichier
- Fichier
  
  19. Neural networks Fichier
- Fichier
  
  20. Visualization Fichier
- Fichier
  
  21. Ensemble methods Fichier
- Fichier
  
  22. File I/O Fichier
- Fichier
  
  23. Parallel R Fichier
- Fichier
  
  24. High-performance R Fichier
Assignments
- Devoir
  
  Assignment 1 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 15 septembre 2022, 10:00
  
  À remettre : jeudi 22 septembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 2 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 22 septembre 2022, 10:00
  
  À remettre : jeudi 29 septembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 3 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 29 septembre 2022, 10:00
  
  À remettre : jeudi 6 octobre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 4 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 6 octobre 2022, 10:00
  
  À remettre : jeudi 13 octobre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 5 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 13 octobre 2022, 10:00
  
  À remettre : jeudi 27 octobre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 6 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 27 octobre 2022, 10:00
  
  À remettre : jeudi 3 novembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 7 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 3 novembre 2022, 10:00
  
  À remettre : jeudi 10 novembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 8 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 10 novembre 2022, 10:00
  
  À remettre : jeudi 17 novembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 9 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 17 novembre 2022, 10:00
  
  À remettre : jeudi 24 novembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 10 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 24 novembre 2022, 10:00
  
  À remettre : jeudi 1 décembre 2022, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 11 - Make-up Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 1 décembre 2022, 10:00
  
  À remettre : jeudi 8 décembre 2022, 23:59

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