Cours : MSC1090 Introduction to Computational Biostatistics with R (Fall 2023)

Aperçu des sections

General

Tout replier Tout déplier
- MSC1090 Introduction to Computational Biostatistics with R (Fall 2023)
  The goal of this course is to prepare graduate students to perform scientific data analysis using the R programming language. Successful students will learn how to use statistical inference and machine-learning tools to gain insight into data sets, as well as be introduced to techniques and best practises for storing, managing and analyzing data. Topics will include: R programming, version control, modular programming, coding best practices, data analysis, machine learning and scientific visualization.
  Classes will be held Tuesdays and Thursdays, 9:00-10:30am, in SS1085.
  Students willing to take the course as part of their graduate program must enrol through Acorn. This course is part of the IMS graduate program.
  Teachers: Alexey Fedoseev, Erik Spence
  Start date: 12 Sep 2023
  End date: 30 Nov 2023
  Scientific Computing Credits: 8
  Data Science Credits: 28
  Events:
  MSC1090 lecture 1 - Tuesday, 12 September, 9:00 AM » 10:30 AM
  MSC1090 lecture 2 - Thursday, 14 September, 9:00 AM » 10:30 AM
  MSC1090 lecture 3 - Tuesday, 19 September, 9:00 AM » 10:30 AM
  A full list of course events can be found here.
- Page
  
  Software Requirements Page
- Forum
  
  Student forum
- Forum
  
  Announcements Forum
- Page
  
  Course Evaluation Page
Lectures
- Fichier
  
  1. Introduction to the Linux command line I Fichier
- Fichier
  
  2. Introduction to the Linux command line II Fichier
- Fichier
  
  3. Introduction to R Fichier
- Fichier
  
  4. Vectors and data frames Fichier
- Fichier
  
  5. Lists, loops and conditional statements in R Fichier
- Fichier
  
  6. Functions in R Fichier
- Fichier
  
  7. Scripts Fichier
- Fichier
  
  8. Version Control System - Git Fichier
- Fichier
  
  9. Coding Best Practices Fichier
- Fichier
  
  10. Distributions Fichier
- Fichier
  
  11. Hypothesis tests Fichier
- Fichier
  
  12. ANOVA Fichier
- Fichier
  
  13. Linear models Fichier
- Fichier
  
  14. Generalized linear models Fichier
- Fichier
  
  15. Resampling Fichier
- Fichier
  
  16. Classification I Fichier
- Fichier
  
  17. Unsupervised learning Fichier
- Fichier
  
  18. Classification II Fichier
- Fichier
  
  19. Neural networks Fichier
- Fichier
  
  20. Visualization Fichier
- Fichier
  
  21. Ensemble methods Fichier
- Fichier
  
  22. File I/O Fichier
- Fichier
  
  23. Parallel Computing in R Fichier
- Fichier
  
  24. High-Performance Computing in R Fichier
Recordings
- Fichier
  
  1. Introduction to Linux command line I Fichier
- Fichier
  
  2. Introduction to the Linux command line II Fichier
- Fichier
  
  Introduction to R Fichier
- Fichier
  
  4. Vectors and data frames Fichier
- Fichier
  
  5. Lists, loops, and conditional statements Fichier
- Fichier
  
  6. Functions Fichier
- Fichier
  
  7. Scripts Fichier
- Fichier
  
  8. Version control Fichier
- Fichier
  
  9. Coding best practices Fichier
- Fichier
  
  10. Distributions Fichier
- Fichier
  
  11. Hypothesis tests Fichier
- Fichier
  
  12. ANOVA Fichier
- Fichier
  
  13. Linear models Fichier
- Fichier
  
  14. Generalized linear models Fichier
- Fichier
  
  15. Resampling Fichier
- Fichier
  
  16. Classification I Fichier
- Fichier
  
  17. Unsupervised learning Fichier
- Fichier
  
  18. Classification II Fichier
- Fichier
  
  19. Neural networks Fichier
- Fichier
  
  20. Visualization Fichier
- Fichier
  
  21. Ensemble methods Fichier
- Fichier
  
  22. File I/O Fichier
- Fichier
  
  23. Parallel Computing in R Fichier
- Fichier
  
  24. High-performance R Fichier
Assignments
- Devoir
  
  Assignment 1 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 14 septembre 2023, 10:00
  
  À rendre : jeudi 21 septembre 2023, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 2 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 21 septembre 2023, 10:00
  
  À rendre : jeudi 28 septembre 2023, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 3 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 28 septembre 2023, 10:00
  
  À rendre : jeudi 5 octobre 2023, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 4 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 5 octobre 2023, 10:00
  
  À rendre : jeudi 12 octobre 2023, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 5 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 12 octobre 2023, 10:00
  
  À rendre : jeudi 19 octobre 2023, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 6 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 19 octobre 2023, 10:00
  
  À rendre : jeudi 26 octobre 2023, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 7 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 26 octobre 2023, 10:00
  
  À rendre : jeudi 2 novembre 2023, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 8 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 2 novembre 2023, 10:00
  
  À rendre : jeudi 16 novembre 2023, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 9 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 16 novembre 2023, 10:00
  
  À rendre : jeudi 23 novembre 2023, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 10 Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 23 novembre 2023, 10:00
  
  À rendre : jeudi 30 novembre 2023, 23:59
- Devoir
  
  Assignment 11 - Make-up Devoir
  
  Ouvert le : jeudi 30 novembre 2023, 10:00
  
  À rendre : jeudi 7 décembre 2023, 23:59

Aperçu des sections

General

MSC1090 Introduction to Computational Biostatistics with R (Fall 2023)

Lectures

Recordings

Assignments